Чрезвычайная контрастность экологических условий, в сочетании с географическим положением на стыке лесной и степной природных зон обуславливает удивительное разнообразие животного мира национального парка.
Благодаря неоднородности рельефа на территории национального парка сформировалось высокое разнообразие типов ландшафтов: степи, лесостепи, леса, субальпийские и альпийские луга, высокогорные тундры, болота, пресные водоемы, долинные луга и кустарники, песчаные массивы.
Тункинский национальный парк находится между двумя великими озерами Азии — Байкалом и Хубсугулом, между величественными горными хребтами — Тункинские Гольцы, Хамар Дабан и Большой Саян. Особый микроклимат создает условия для произрастания и обитания большого числа видов животного и растительного мира.